潔凈醫學實驗室承擔著各類醫療機構的樣本檢測、醫療科學和醫療技術研究、醫療人才培養等重要工作，是各類醫療機構建設不可缺少的組成部分，本文所涉及的潔凈醫學實驗室主要包括以下類型的實驗室：無菌實驗室、PCR實驗室（基因擴增實驗室）、生物治療中心、PET中心（正電子發射計算機斷層顯像中心）、生物安全實驗室。
無菌實驗室主要是指用于微生物學、生物醫學、生物化學、動物實驗、基因重組以及生物制品等研究使用的實驗室，這類實驗室通常為正壓實驗室，主要的參考標準為《潔凈廠房設計規范》GB50073-2013、《潔凈室施工及驗收規范》GB50591-2010。
PCR實驗室（基因擴增實驗室）是指通過擴增檢測特定的DNA或RNA，進行疾病診斷、治療監測和預后判定等的實驗室，這類實驗室通常為負壓或者相對負壓實驗室，主要的參考標準為《臨床基因擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》（衛醫發〔2010〕194號）。
PET中心（正電子發射計算機斷層顯像中心）是集核物理、放射化學、分子生物學、醫學影像學和計算機等高新技術之大成，從分子水平上反映人體的生理、病理變化、代謝改變的顯像實驗室，PET中心設計的主要的參考標準為《藥品生產質量管理規范（2010年修訂）、《開放型放射性物質實驗室輻射防護設計規范》EJ380-1989。
生物安全實驗室是從事對實驗人員和環境有一定危害的生物因子操作的實驗室，生物安全實驗室根據所從事的生物因子的危害性分為4個級別，這類實驗室通常為負壓實驗室，主要的參考標準為《實驗室 生物安全通用要求》GB19489-2008、《生物安全實驗室建筑技術規范》GB50346-2011、《醫學實驗室安全認可準則》CNAS-CL36（ISO15190:2003），生物治療中心和HIV實驗室（性病、艾滋病實驗室）均屬于生物安全實驗室，生物治療中心是指采用生物免疫療法治療治療各類疾病的實驗室，HIV實驗室（性病、艾滋病實驗室）是指從事性病、艾滋病研究的實驗室。
